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要将手机中的卡1和卡2的短信分开，可以通过以下方法实现。
1、不同的短信应用：可以为卡1和卡2各自安装一个独立的短信应用，短信”和“双卡短信”，通过这两个应用，可以分别管理和接收两个卡号的短信。
2、系统设置：对于部分手机，可以在系统设置中直接设置默认短信卡，在该设置下，可以为卡1和卡2分别设置不同的短信应用或短信收件箱，从而实现短信的分开管理。
3、短信界面查看：当收到短信时，可以在短信应用界面的上方或短信详情中查看发送短信的卡号，通过这种方式，可以轻松地区分哪个卡收到了短信。
具体操作步骤可能因手机型号或操作系统版本而异，建议查看手机说明书或在线查找针对特定设备的详细指南，如果对操作不确定，建议咨询手机品牌官方客服或专业手机维修人员。